MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Corynebacterium diphtheriae NCTC 13129 chromosome

Total Repeats: 44980

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_002935	CTG	2	6	101	106	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	38232643
2	NC_002935	AAC	2	6	107	112	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	38232643
3	NC_002935	CGT	2	6	241	246	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	38232643
4	NC_002935	CAC	2	6	343	348	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	38232643
5	NC_002935	ACT	2	6	365	370	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	38232643
6	NC_002935	ACA	2	6	422	427	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	38232643
7	NC_002935	CGA	2	6	438	443	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	38232643
8	NC_002935	CAG	2	6	511	516	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	38232643
9	NC_002935	TCG	3	9	540	548	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	38232643
10	NC_002935	AGC	3	9	557	565	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	38232643
11	NC_002935	GAA	2	6	583	588	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	38232643
12	NC_002935	CGC	2	6	604	609	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	38232643
13	NC_002935	GA	3	6	612	617	50 %	0 %	50 %	0 %	38232643
14	NC_002935	CAA	2	6	696	701	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	38232643
15	NC_002935	CGG	2	6	713	718	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	38232643
16	NC_002935	GC	4	8	742	749	0 %	0 %	50 %	50 %	38232643
17	NC_002935	TTC	2	6	861	866	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	38232643
18	NC_002935	TGA	2	6	903	908	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	38232643
19	NC_002935	CGA	2	6	960	965	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	38232643
20	NC_002935	TTC	2	6	1006	1011	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	38232643
21	NC_002935	CA	3	6	1012	1017	50 %	0 %	0 %	50 %	38232643
22	NC_002935	GCA	2	6	1029	1034	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	38232643
23	NC_002935	CCGC	2	8	1065	1072	0 %	0 %	25 %	75 %	38232643
24	NC_002935	CCA	2	6	1144	1149	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	38232643
25	NC_002935	CGG	2	6	1190	1195	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	38232643
26	NC_002935	ATG	2	6	1354	1359	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	38232643
27	NC_002935	GCAG	2	8	1365	1372	25 %	0 %	50 %	25 %	38232643
28	NC_002935	GGCA	2	8	1386	1393	25 %	0 %	50 %	25 %	38232643
29	NC_002935	CTG	2	6	1409	1414	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	38232643
30	NC_002935	TGG	2	6	1548	1553	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	38232643
31	NC_002935	ACG	2	6	1564	1569	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	38232643
32	NC_002935	ACG	2	6	1625	1630	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	38232643
33	NC_002935	CAG	2	6	1636	1641	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	38232643
34	NC_002935	GCA	2	6	1647	1652	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	38232643
35	NC_002935	GAC	2	6	2352	2357	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161598680
36	NC_002935	CGGTG	2	10	2363	2372	0 %	20 %	60 %	20 %	161598680
37	NC_002935	CCA	2	6	2395	2400	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	161598680
38	NC_002935	GC	3	6	2420	2425	0 %	0 %	50 %	50 %	161598680
39	NC_002935	TCA	2	6	2431	2436	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161598680
40	NC_002935	CCG	2	6	2437	2442	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161598680
41	NC_002935	GCCA	2	8	2515	2522	25 %	0 %	25 %	50 %	161598680
42	NC_002935	CAT	2	6	2558	2563	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	161598680
43	NC_002935	TCG	2	6	2596	2601	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161598680
44	NC_002935	TTC	2	6	2630	2635	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	161598680
45	NC_002935	CGA	2	6	2663	2668	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161598680
46	NC_002935	TGC	2	6	2737	2742	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161598680
47	NC_002935	TGC	2	6	2747	2752	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161598680
48	NC_002935	ACG	2	6	2858	2863	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161598680
49	NC_002935	GAA	2	6	2918	2923	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	161598680
50	NC_002935	ACC	2	6	3045	3050	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	161598680
51	NC_002935	GCT	2	6	3089	3094	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161598680
52	NC_002935	CCG	2	6	3152	3157	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	161598680
53	NC_002935	TC	3	6	3221	3226	0 %	50 %	0 %	50 %	161598680
54	NC_002935	TGG	2	6	3230	3235	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	161598680
55	NC_002935	AAGC	2	8	3424	3431	50 %	0 %	25 %	25 %	161598680
56	NC_002935	ACCT	2	8	3468	3475	25 %	25 %	0 %	50 %	161598680
57	NC_002935	TTG	2	6	3624	3629	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	38232645
58	NC_002935	TTG	2	6	3657	3662	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	38232645
59	NC_002935	GT	3	6	3699	3704	0 %	50 %	50 %	0 %	38232645
60	NC_002935	GT	3	6	3747	3752	0 %	50 %	50 %	0 %	38232645
61	NC_002935	GCT	2	6	3862	3867	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	38232645
62	NC_002935	GTT	2	6	3872	3877	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	38232645
63	NC_002935	TGC	2	6	4011	4016	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	38232645
64	NC_002935	CAG	2	6	4041	4046	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	38232645
65	NC_002935	TGC	2	6	4048	4053	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	38232645
66	NC_002935	CGT	2	6	4058	4063	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	38232645
67	NC_002935	TGA	2	6	4075	4080	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	38232645
68	NC_002935	TG	3	6	4102	4107	0 %	50 %	50 %	0 %	38232645
69	NC_002935	TGG	2	6	4129	4134	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	38232645
70	NC_002935	TCAT	2	8	4140	4147	25 %	50 %	0 %	25 %	38232645
71	NC_002935	ATG	2	6	4188	4193	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	38232645
72	NC_002935	TGT	2	6	4264	4269	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	38232645
73	NC_002935	GAA	2	6	4286	4291	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	38232645
74	NC_002935	TGCT	2	8	4305	4312	0 %	50 %	25 %	25 %	38232645
75	NC_002935	TGG	2	6	4359	4364	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	38232645
76	NC_002935	TGA	2	6	4375	4380	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	38232645
77	NC_002935	TGT	2	6	4387	4392	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	38232645
78	NC_002935	TGC	2	6	4479	4484	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	38232645
79	NC_002935	ATG	2	6	4488	4493	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	38232645
80	NC_002935	GAT	2	6	4517	4522	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	38232645
81	NC_002935	CGT	2	6	4547	4552	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	38232645
82	NC_002935	TCA	2	6	4593	4598	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	38232645
83	NC_002935	GGTG	2	8	4606	4613	0 %	25 %	75 %	0 %	38232645
84	NC_002935	CGG	2	6	4641	4646	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	38232645
85	NC_002935	CGC	2	6	4705	4710	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	38232645
86	NC_002935	ATG	2	6	4735	4740	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	38232645
87	NC_002935	CTG	2	6	4747	4752	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	38232646
88	NC_002935	AGG	2	6	4771	4776	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	38232646
89	NC_002935	A	6	6	4779	4784	100 %	0 %	0 %	0 %	38232646
90	NC_002935	ACG	2	6	4849	4854	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	38232646
91	NC_002935	AAC	2	6	4873	4878	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	38232646
92	NC_002935	GTC	2	6	4903	4908	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	38232646
93	NC_002935	GGC	3	9	4909	4917	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	38232646
94	NC_002935	A	6	6	4965	4970	100 %	0 %	0 %	0 %	38232646
95	NC_002935	GAT	2	6	5019	5024	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	38232646
96	NC_002935	TGC	2	6	5042	5047	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	38232646
97	NC_002935	ATG	2	6	5127	5132	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	38232646
98	NC_002935	TAT	2	6	5138	5143	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	38232646
99	NC_002935	ATC	2	6	5178	5183	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	38232646
100	NC_002935	GGC	2	6	5221	5226	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	38232646
101	NC_002935	CAC	2	6	5505	5510	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	38232647
102	NC_002935	CGA	2	6	5540	5545	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	38232647
103	NC_002935	CGG	2	6	5594	5599	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	38232647
104	NC_002935	GGT	2	6	5730	5735	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	38232647
105	NC_002935	CGT	2	6	5756	5761	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	38232647
106	NC_002935	ACC	2	6	5883	5888	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	38232647
107	NC_002935	ACC	2	6	5925	5930	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	38232647
108	NC_002935	CTT	2	6	5972	5977	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	38232647
109	NC_002935	GAA	2	6	6051	6056	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	38232647
110	NC_002935	TCGATG	2	12	6091	6102	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	38232647
111	NC_002935	CTG	2	6	6124	6129	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	38232647
112	NC_002935	GAA	3	9	6146	6154	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	38232647
113	NC_002935	TCT	2	6	6160	6165	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	38232647
114	NC_002935	CCACC	2	10	6221	6230	20 %	0 %	0 %	80 %	38232647
115	NC_002935	ATC	2	6	6231	6236	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	38232647
116	NC_002935	AAC	2	6	6288	6293	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	38232647
117	NC_002935	CGT	2	6	6382	6387	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	38232647
118	NC_002935	TGA	2	6	6388	6393	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	38232647
119	NC_002935	GCT	2	6	6416	6421	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	38232647
120	NC_002935	AAGGAA	2	12	6423	6434	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	38232647
121	NC_002935	GAC	2	6	6450	6455	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	38232647
122	NC_002935	CCG	2	6	6472	6477	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	38232647
123	NC_002935	AGACCA	2	12	6517	6528	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	38232647
124	NC_002935	ATC	2	6	6624	6629	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	38232647
125	NC_002935	GC	3	6	6654	6659	0 %	0 %	50 %	50 %	38232647
126	NC_002935	GGC	2	6	6662	6667	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	38232647
127	NC_002935	GC	3	6	6675	6680	0 %	0 %	50 %	50 %	38232647
128	NC_002935	CGT	2	6	6690	6695	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	38232647
129	NC_002935	CGG	2	6	6713	6718	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	38232647
130	NC_002935	GGT	2	6	6798	6803	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	38232647
131	NC_002935	TTC	2	6	6841	6846	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	38232647
132	NC_002935	ATC	2	6	6921	6926	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	38232647
133	NC_002935	ATG	2	6	6949	6954	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	38232647
134	NC_002935	AAG	2	6	6966	6971	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	38232647
135	NC_002935	TGC	2	6	7036	7041	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	38232647
136	NC_002935	GAA	2	6	7077	7082	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	38232647
137	NC_002935	CTTG	2	8	7175	7182	0 %	50 %	25 %	25 %	38232647
138	NC_002935	CAA	2	6	7211	7216	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	38232647
139	NC_002935	GAC	2	6	7218	7223	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	38232647
140	NC_002935	CGA	2	6	7340	7345	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	38232647
141	NC_002935	TCT	2	6	7348	7353	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	38232647
142	NC_002935	GAC	2	6	7368	7373	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	38232647
143	NC_002935	TTA	2	6	7393	7398	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	38232647
144	NC_002935	CCG	2	6	7400	7405	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	38232647
145	NC_002935	TGC	2	6	7563	7568	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	38232648
146	NC_002935	TGC	2	6	7672	7677	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	38232648
147	NC_002935	AAG	2	6	7718	7723	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	38232648
148	NC_002935	GGC	2	6	7806	7811	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	38232648
149	NC_002935	GCT	2	6	7891	7896	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	38232648
150	NC_002935	A	6	6	8235	8240	100 %	0 %	0 %	0 %	38232649
151	NC_002935	ATC	2	6	8261	8266	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	38232649
152	NC_002935	GGT	2	6	8354	8359	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	38232649
153	NC_002935	CGG	2	6	8362	8367	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	38232649
154	NC_002935	GC	3	6	8419	8424	0 %	0 %	50 %	50 %	38232649
155	NC_002935	GCCTA	2	10	8484	8493	20 %	20 %	20 %	40 %	38232650
156	NC_002935	GGCG	2	8	8525	8532	0 %	0 %	75 %	25 %	38232650
157	NC_002935	CTT	2	6	8543	8548	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	38232650
158	NC_002935	GCT	2	6	8566	8571	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	38232650
159	NC_002935	GCG	2	6	8572	8577	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	38232650
160	NC_002935	TGG	2	6	8588	8593	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	38232650
161	NC_002935	TGC	2	6	8606	8611	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	38232650
162	NC_002935	GAG	2	6	8628	8633	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	38232650
163	NC_002935	GC	3	6	8639	8644	0 %	0 %	50 %	50 %	38232650
164	NC_002935	CTG	2	6	8654	8659	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	38232650
165	NC_002935	CGA	2	6	8797	8802	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	38232651
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167	NC_002935	GGT	2	6	8810	8815	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	38232651
168	NC_002935	GAG	2	6	8852	8857	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	38232651
169	NC_002935	TCG	2	6	8895	8900	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	38232651
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174	NC_002935	CG	3	6	9291	9296	0 %	0 %	50 %	50 %	38232651
175	NC_002935	CTG	2	6	9305	9310	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	38232651
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244	NC_002935	TTC	2	6	12248	12253	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	38232653
245	NC_002935	GC	3	6	12258	12263	0 %	0 %	50 %	50 %	38232653
246	NC_002935	ATG	2	6	12372	12377	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	38232653
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249	NC_002935	ATGC	2	8	12629	12636	25 %	25 %	25 %	25 %	38232653
250	NC_002935	CTG	2	6	12655	12660	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	38232653
251	NC_002935	CCGGTG	2	12	12702	12713	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	38232653
252	NC_002935	AG	3	6	12767	12772	50 %	0 %	50 %	0 %	38232653
253	NC_002935	CTT	2	6	12865	12870	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	38232653
254	NC_002935	GAG	2	6	13058	13063	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	38232654
255	NC_002935	ACC	2	6	13072	13077	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	38232654
256	NC_002935	GCG	2	6	13131	13136	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	38232654
257	NC_002935	ATC	2	6	13158	13163	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	38232654
258	NC_002935	CGA	2	6	13168	13173	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	38232654
259	NC_002935	T	6	6	13237	13242	0 %	100 %	0 %	0 %	38232654
260	NC_002935	CGG	2	6	13288	13293	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	38232654
261	NC_002935	GAA	2	6	13319	13324	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	38232654
262	NC_002935	TGC	2	6	13331	13336	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	38232654
263	NC_002935	GTC	2	6	13505	13510	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	38232654
264	NC_002935	CGA	2	6	13531	13536	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	38232654
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268	NC_002935	CGA	2	6	13732	13737	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	38232654
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271	NC_002935	GCA	2	6	13858	13863	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	38232654
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